В сентябре климат в Зай-Каратае можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 15 градусов тепла. В среднем в сентябре в Зай-Каратае 13 дождливых, 9 пасмурных, 5 ясных и 3 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные.