В июне климат в Заполярном можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 10 градусов тепла. В среднем в июне в Заполярном 21 дождливый, 8 пасмурных и 1 ясный день. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в мае, июле, августе и сентябре Заполярный cчитается местом, некомфортным для посещения.