В марте климат в Йонагуни можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в марте 21 градус тепла. В среднем в марте в Йонагуни 24 дождливых, 6 ясных и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В марте, а также в январе, феврале, мае и июне Йонагуни cчитается местом, некомфортным для посещения.