Сентябрь в Верхнем Пенжино — самый дождливый месяц в году. В сентябре климат в Верхнем Пенжино можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 4 градуса тепла. В среднем в сентябре в Верхнем Пенжино 8 дней с переменной облачностью, 7 ясных, 7 пасмурных, 6 дождливых и 2 дня со снегом. Дожди преимущественно слабые.