В мае климат в Варденисе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в мае 10 градусов тепла. В среднем в мае в Варденисе 23 дождливых и 8 ясных дней. Дожди преимущественно сильные. В мае, а также в марте, апреле, июне и сентябре Варденис cчитается местом, некомфортным для посещения.