В сентябре климат в Усть-Неме можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 10 градусов тепла. В среднем в сентябре в Усть-Неме 18 дождливых, 11 пасмурных и 1 ясный день. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и октябре Усть-Нем cчитается местом, некомфортным для посещения.