В сентябре климат в Усть-Коже можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Усть-Коже 13 дождливых, 12 пасмурных, 3 с переменной облачностью и 2 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, апреле и октябре Усть-Кожа cчитается местом, некомфортным для посещения.