В сентябре климат в Среднем Карачане можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 18 градусов тепла. В среднем в сентябре в Среднем Карачане 16 дней с переменной облачностью, 11 ясных, 2 дождливых и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в августе Средний Карачан cчитается местом, комфортным для посещения.