В январе климат в Среднеколымске можно охарактеризовать как морозный. Средняя температура днём в январе 30 градусов мороза. В среднем в январе в Среднеколымске 15 пасмурных, 8 с переменной облачностью, 7 ясных и 1 день со снегом. Снегопады преимущественно слабые. В январе, а также в феврале, марте, ноябре и декабре Среднеколымск cчитается местом, некомфортным для посещения.