В июне климат в Саянах можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 13 градусов тепла. В среднем в июне в Саянах 15 дождливых, 8 ясных, 5 с переменной облачностью и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, феврале, марте и июле Саяны cчитается местом, некомфортным для посещения.