В июне климат в Санта-Крусе можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 28 градусов тепла. В среднем в июне в Санта-Крусе 27 дождливых и 3 ясных дня. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, апреле, мае и июле Санта-Крус cчитается местом, некомфортным для посещения.