В июне климат в Санкт-Иоганн-ин-Тироле можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 16 градусов тепла. В среднем в июне в Санкт-Иоганн-ин-Тироле 22 дождливых и 8 ясных дней. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в феврале, марте, апреле и мае Санкт-Иоганн-ин-Тироль cчитается местом, некомфортным для посещения.