Июнь в Сандакане — самый пасмурный и жаркий месяц в году. В июне климат в Сандакане можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 30 градусов тепла. В среднем в июне в Сандакане 29 дождливых и 1 ясный день. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, феврале, марте и апреле Сандакан cчитается местом, некомфортным для посещения.