В сентябре климат в Сан-Диего можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 23 градуса тепла. В среднем в сентябре в Сан-Диего 20 ясных, 9 с переменной облачностью и дождливый день. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в июле и августе Сан-Диего cчитается местом, комфортным для посещения.