В июне климат в Какортоке можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в июне 7 градусов тепла. В среднем в июне в Какортоке 10 пасмурных, 9 дождливых, 6 ясных и 5 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в апреле, мае, июле и августе Какорток cчитается местом, некомфортным для посещения.