В июне климат в Пуэрто-Варасе можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в июне 9 градусов тепла. В среднем в июне в Пуэрто-Варасе 26 дождливых и 4 ясных дня. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в апреле, мае, июле и августе Пуэрто-Варас cчитается местом, некомфортным для посещения.