В сентябре климат в Пуэрто-Вальярта можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в сентябре 29 градусов тепла. В среднем в сентябре в Пуэрто-Вальярта 28 дождливых, 1 ясный и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в июле, августе и октябре Пуэрто-Вальярта cчитается местом, некомфортным для посещения.