Сентябрь в Пуэрто-Мальдонадо — самый жаркий месяц в году. В сентябре климат в Пуэрто-Мальдонадо можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в сентябре 33 градуса тепла. В среднем в сентябре в Пуэрто-Мальдонадо 16 дней с переменной облачностью, 12 ясных и 2 дождливых дня. Дожди преимущественно умеренные.