В январе климат в Попаяне можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в январе 20 градусов тепла. В среднем в январе в Попаяне 30 дождливых и 1 ясный день. Дожди преимущественно сильные. В январе, а также в феврале, марте, апреле и мае Попаян cчитается местом, некомфортным для посещения.