В сентябре климат в Пешкопии можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 17 градусов тепла. В среднем в сентябре в Пешкопии 16 дождливых, 11 ясных и 3 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные.