В июне климат в Ново-Карачаевском городском поселении можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 19 градусов тепла. В среднем в июне в Ново-Карачаевском городском поселении 17 дождливых и 13 ясных дней. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в феврале, марте и мае Ново-Карачаевское городское поселение cчитается местом, некомфортным для посещения.