В сентябре климат в Миконосе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 23 градуса тепла. В среднем в сентябре в Миконосе 30 ясных дней. В сентябре, а также в мае, июне и июле Миконос cчитается местом, комфортным для посещения.