В сентябре климат в Муезерском можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 12 градусов тепла. В среднем в сентябре в Муезерском 13 дождливых, 9 пасмурных, 7 с переменной облачностью и 1 ясный день. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и мае Муезерский cчитается местом, некомфортным для посещения.