В сентябре климат в Менделеевском можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 15 градусов тепла. В среднем в сентябре в Менделеевском 11 пасмурных, 8 дождливых, 6 ясных и 5 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно слабые.