В сентябре климат в Мацзу можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 27 градусов тепла. В среднем в сентябре в Мацзу 19 дождливых, 7 ясных и 4 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в январе, феврале, марте и апреле Мацзу cчитается местом, некомфортным для посещения.