В сентябре климат в Малой Пера можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 10 градусов тепла. В среднем в сентябре в Малой Пера 14 дождливых, 7 пасмурных, 6 с переменной облачностью и 3 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, октябре и декабре Малая Пера cчитается местом, некомфортным для посещения.