В сентябре климат в Малакееве можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 19 градусов тепла. В среднем в сентябре в Малакееве 14 дней с переменной облачностью, 12 ясных и 4 дождливых дня. Дожди преимущественно слабые.