Сентябрь в Когалыме — самый пасмурный месяц в году. В сентябре климат в Когалыме можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 10 градусов тепла. В среднем в сентябре в Когалыме 12 дождливых, 11 пасмурных, 6 с переменной облачностью и 1 ясный день. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, ноябре и декабре Когалым cчитается местом, некомфортным для посещения.