В июне климат в Джэксонвилле можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 32 градуса тепла. В среднем в июне в Джэксонвилле 12 ясных, 11 дождливых и 7 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в мае, июле, августе и декабре Джэксонвилл cчитается местом, некомфортным для посещения.