В июне климат в Джэксонвилле можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 31 градус тепла. В среднем в июне в Джэксонвилле 11 ясных, 10 дождливых, 8 с переменной облачностью и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, феврале, марте и июле Джэксонвилл cчитается местом, некомфортным для посещения.