В сентябре климат в Ишимове можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 13 градусов тепла. В среднем в сентябре в Ишимове 22 дождливых, 5 пасмурных и 3 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и октябре Ишимово cчитается местом, некомфортным для посещения.