В июне климат в Исафьордюре можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в июне 8 градусов тепла. В среднем в июне в Исафьордюре 15 дождливых, 9 пасмурных, 4 ясных и 2 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В июне, а также в январе, апреле, мае и июле Исафьордюр cчитается местом, некомфортным для посещения.