Июнь в Фудзи — самый пасмурный месяц в году. В июне климат в Фудзи можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 20 градусов тепла. В среднем в июне в Фудзи 25 дождливых, 3 пасмурных и 2 ясных дня. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в феврале, марте, апреле и мае Фудзи cчитается местом, некомфортным для посещения.