В сентябре климат в Котону можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в сентябре 28 градусов тепла. В среднем в сентябре в Котону 25 дождливых, 4 с переменной облачностью и 1 ясный день. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в марте, апреле, мае и июне Котону cчитается местом, некомфортным для посещения.