В сентябре климат в Ханиоти можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 23 градуса тепла. В среднем в сентябре в Ханиоти 25 ясных, 3 с переменной облачностью и 2 дождливых дня. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в июне и июле Ханиоти cчитается местом, комфортным для посещения.