В сентябре климат в Чаинске можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Чаинске 14 дождливых, 9 пасмурных, 5 ясных и 2 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и октябре Чаинск cчитается местом, некомфортным для посещения.