В сентябре климат в Ботукату можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 28 градусов тепла. В среднем в сентябре в Ботукату 16 ясных, 8 дождливых, 5 с переменной облачностью и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно сильные.