В июне климат в Благоевом можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 16 градусов тепла. В среднем в июне в Благоевом 10 пасмурных, 8 дождливых, 7 с переменной облачностью и 5 ясных дней. Дожди преимущественно умеренные.