В сентябре климат в Бэй-Сити можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 21 градус тепла. В среднем в сентябре в Бэй-Сити 16 ясных, 10 с переменной облачностью и 4 дождливых дня. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в августе Бэй-Сити cчитается местом, комфортным для посещения.