В сентябре климат в Балыктуюле можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 9 градусов тепла. В среднем в сентябре в Балыктуюле 17 ясных, 11 с переменной облачностью и 2 дождливых дня. Дожди преимущественно слабые.