В мае климат в Бабаойо можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в мае 29 градусов тепла. В среднем в мае в Бабаойо 31 дождливый день. Дожди преимущественно сильные. В мае, а также в январе, феврале, марте и апреле Бабаойо cчитается местом, некомфортным для посещения.