В сентябре климат в Аккайтыме можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 22 градуса тепла. В среднем в сентябре в Аккайтыме 23 ясных и 7 дней с переменной облачностью. В сентябре, а также в мае Аккайтым cчитается местом, комфортным для посещения.