В июне климат в Агапине можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 22 градуса тепла. В среднем в июне в Агапине 12 дней с переменной облачностью, 9 дождливых и 9 ясных дней. Дожди преимущественно умеренные.