В сентябре климат в Жалгызапане можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 22 градуса тепла. В среднем в сентябре в Жалгызапане 19 ясных, 10 с переменной облачностью и дождливый день. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в мае Жалгызапан cчитается местом, комфортным для посещения.