В сентябре климат в Зеленоградске можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 17 градусов тепла. В среднем в сентябре в Зеленоградске 10 ясных, 9 дождливых, 9 с переменной облачностью и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно умеренные.