В июне климат в Заполярном можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 12 градусов тепла. В среднем в июне в Заполярном 12 дождливых, 7 пасмурных, 7 с переменной облачностью и 4 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В июне, а также в январе, феврале, марте и мае Заполярный cчитается местом, некомфортным для посещения.