В сентябре климат в Яани можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 22 градуса тепла. В среднем в сентябре в Яани 24 дождливых, 2 ясных, 2 пасмурных и 2 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в январе, феврале, марте и апреле Яань cчитается местом, некомфортным для посещения.