В сентябре климат в Верхнем Мангиртуе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 16 градусов тепла. В среднем в сентябре в Верхнем Мангиртуе 11 ясных, 9 с переменной облачностью, 8 дождливых и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно слабые.