В июне климат в Усть-Семе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 21 градус тепла. В среднем в июне в Усть-Семе 16 дождливых, 7 ясных и 7 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, марте, апреле и мае Усть-Сема cчитается местом, некомфортным для посещения.