В сентябре климат в Усть-Коксе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Усть-Коксе 12 ясных, 8 дождливых, 6 с переменной облачностью, 3 пасмурных и 1 день со снегом. Дожди преимущественно сильные.